Environmental and genetic modifiers of squint penetrance during zebrafish embryogenesis

Vincent Fleury, le 09-01-2007 à 15:13 : Je suis désolé de devoir insister : ouvrez vos yeux, ça n’a AUCUN sens d’invoquer la fonction d’un organe, si l’ensemble des modifications possibles d’un animal ne sont pas quelconques. L’influence de l’environnement sur le développement de UN animal est égal à ZERO, et l’influence sur les mutations est égale à ZERO. ZERO fois ZERO= ZERO.

Je trouve que ce sont les dires de VF qui ont de moins en moins de sens et que c’est leur influence qui devrait tendre vers zéro.

Environmental and genetic modifiers of squint penetrance during zebrafish embryogenesis

Wuhong Pei, P. Huw Williams, Matthew D. Clark, Derek L. Stemple, , and Benjamin Feldman

Developmental Biology Volume 308, Issue 2, 15 August 2007, Pages 368-378

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Tsukushi cooperates with VG1 to induce primitive streak and Hensen’s node formation in the chick embryo

Vincent Fleury, SLT, 10-01-2007 à 17:27 : Bon évidemment, mon point de vue a légèrement évolué depuis le premier papier: pour faire un peu plaisir aux biologistes, j’ai laissé le pôle attracteur. Je crois qu’il n’est même pas nécessaire. Le mouvement est générique.

Une fois que c’est parti, le pôle est réduit en bouillie par le mouvement lui-même. De toute façon on ne peut pas sans sortir sans de l’advection diffusion, et quand vous voyez les moulinets que fait la blastula, ça laisse songeur sur le rôle des molécules.


Tsukushi cooperates with VG1 to induce primitive streak and Hensen’s node formation in the chick embryo

Kunimasa Ohta, Sei Kuriyama, Tatsuya Okafuji, Ryu Gejima, Shin-ichi Ohnuma and Hideaki Tanaka

Development 133, 3777-3786 (2006) doi:10.1242/dev.02579

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Biology by Numbers—Introducing Quantitation into Life Science Education

Biology by Numbers—Introducing Quantitation into Life Science Education

Tinri Aegerter-Wilmsen, Ton Bisseling

PLoS Biol 3(1): e1 doi:10.1371/journal.pbio.0030001

[…]

A Modelling Module in Developmental Biology

As an example of the integration of quantitative teaching and cutting edge biology, we have implemented an educational module in which numerical simulations are used in an existing course on developmental biology (http://mbedu.fbt.eitn.wau.nl/demo_plos/). Some of the features of this module and the thinking that led to its development are quite general, and so we present the module here as a case study in the hope that this might inspire and guide others to create similar resources.

Bon exercice pour se dérouiller les neurones (à éviter par certains physiciens qui risqueraient de voir leur tension nerveuse s’élever inutilement).

Determination of embryonic polarity in a regulative system…

Vincent Fleury, SLT, 10-01-2007 à 17:27 : Bon évidemment, mon point de vue a légèrement évolué depuis le premier papier: pour faire un peu plaisir aux biologistes, j’ai laissé le pôle attracteur. Je crois qu’il n’est même pas nécessaire. Le mouvement est générique.

Une fois que c’est parti, le pôle est réduit en bouillie par le mouvement lui-même. De toute façon on ne peut pas sans sortir sans de l’advection diffusion, et quand vous voyez les moulinets que fait la blastula, ça laisse songeur sur le rôle des molécules.


Determination of embryonic polarity in a regulative system: evidence for endogenous inhibitors acting sequentially during primitive streak formation in the chick embryo

Federica Bertocchini, Isaac Skromne, Lewis Wolpert and Claudio D. Stern

Development 131, 3381-3390 doi:10.1242/dev.01178

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The dorsoventral polarity of the presumptive limb is determined by…

Papier très instructif, produit par une équipe française, ce qui évitera à Vincent Fleury de faire des commentaires désobligeants, américano(xéno?)phobes. Et lui permettra peut-être de se renseigner auprès de ses collègues du CNRS.
Plusieurs points sont en contradiction avec la façon de présenter de VF sur FAQ19; après l’épisode du positionnement de L2/R2 j’ai nette tendance à me ranger du côté des embryologistes, d’autant plus qu’ils présentent des données expérimentales et non pas des petits dessins merdiques.


The dorsoventral polarity of the presumptive limb is determined by signals produced by the somites and by the lateral somatopleure

Jacques L. Michaud, Françoise Lapointe and Nicole M. Le Douarin

Development 124, 1453-1463 (1997)

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Retinoic acid is required for the initiation of outgrowth in the chick limb bud

Quand on a trouvé une molécule qui déplace les bourgeons des membres du poulet, et que c’est une protéine, un facteur de transcription à l’occurrence, on se demande si on ne peut trouver quelque chose de plus simple. Et il suffit de chercher pour trouver (voir figure 2, (b)), dans ce cas dans la littérature.
A nouveau se pose la question à Vincent Fleury, comment ces résultats expérimentaux pourraient se concilier avec son hypothèse ?
A mon avis ce n’est pas possible.
shifted2.jpg


Retinoic acid is required for the initiation of outgrowth in the chick limb bud

Thomas Stratford, Claire Horton and Malcolm Maden

Current Biology1996, Vol 6 No 9

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Tbx3 can alter limb position along the rostrocaudal axis of the developing embryo

Mince, un gène dont l’expression ectopique déplace les « pattes » ! Il y en a qui pensent que les emplacements sont dus à des vortexes, faudrait qu’ils expliquent ça, aussi. Ou pourquoi l’expression du dit gène affecte l’emplacement des « fantômes » des buds formés par des tourbillons.
Vincent Fleury, une idée ?


10.1242/10.1242/dev.01787, fig 2

Tbx3 can alter limb position along the rostrocaudal axis of the developing embryo

Charalampos Rallis, Jo Del Buono and Malcolm P. O. Logan

Development 132, 1961-1970 (2005) doi: 10.1242/10.1242/dev.01787

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